古いWebアプリケーションフレームワークをつかい
MySQL5.6までのMySQLデータベースをつかったアプリケーションを
MySQL5.7のサーバーに移転するにあたり

ORDER BY clause is not in SELECT list, references column...

というようなエラーが出た場合、MySQL5.7より「ONLY_FULL_GROUP_BY」がオンになっていることが原因だ。

このあたりは、すでに多くの先駆者が設定について書いてくださっている。

など。大変ありがたい情報だ。

しかし、さくらインターネットでは権限がない

さくらインターネットなど共有サーバーでは、これらの設定については、
権限付与がなく設定ができない。

さてどうしたものか。。。

そのセッションのみで、（MySQL Workbenchをつかっている経験から）SQLMODEの変更ができるはず。
ということで

SET SESSION sql_mode = 'NO_ZERO_IN_DATE,NO_ZERO_DATE,ERROR_FOR_DIVISION_BY_ZERO,NO_AUTO_CREATE_USER,NO_ENGINE_SUBSTITUTION';

毎回接続時に実行できればOKなはず。と考察して、調べた結果問題なしでした。
各フレームワークや、自作のシステムの場合も、
mysqli_connect関数の直後や、new PDO()直後あたりで毎回実行するようにすればOKです。